RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
CPR4	YCR069W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YGL088W	P53151	121 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YMR295C	Q03559	197 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	PBA1	Q05778	276 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YLR296W	Q05898	108 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YAL065C	O13511	128 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YER085C	P40058	173 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	DYN1	P36022	4092 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	PAI3	P01094	68 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	OXA1	P39952	402 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
CPR4	YCR069W	YER181C	P40097	107 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	CIN5	P40917	295 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	CWP2	P43497	92 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YDR115W	Q04598	105 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YPL229W	Q99395	206 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	UGX2	P32772	223 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YBR219C	P38317	127 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	SVP26	P38869	228 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YNR077C	P53758	84 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	ABF2	Q02486	183 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	COX10	P21592	462 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YHR130C	P38834	111 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	MRPS12	P53732	153 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	AQY2	P0CD90	149 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	ANB1	P19211	157 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YIA6	P40556	373 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YFL067W	P43537	175 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	EOS1	P53938	366 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	RGM1	Q00453	211 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CPR4	YCR069W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YEL067C	P39978	195 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	MVB12	P42939	101 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YFL019C	P43576	117 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	STF1	P01098	86 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YAL064W	P39711	94 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YDR029W	Q12111	104 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YEL045C	P32616	141 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	SNA2	P56508	79 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	HPA2	Q06592	156 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	MHR1	Q06630	226 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	ECM12	O13529	151 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	UBC4	P15731	148 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YFR057W	P43625	151 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YNL190W	P53872	204 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	SFT1	P43682	97 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	ICY1	Q04329	127 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	AIM19	P40502	157 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	HUR1	P45820	110 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	KNH1	P50112	268 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YPL257W	Q08974	193 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	IRC21	Q04772	201 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	RRT15	Q3E811	62 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CPR4	YCR069W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	YNL198C	P40166	100 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	YCR085W	P25650	117 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	MID2	P36027	376 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	YGL193C	P53097	103 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	LCL1	Q02786	101 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	FYV5	P25585	152 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	MSA2	P36157	363 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	PEX22	P39718	180 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	YPR195C	Q06594	109 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	TSC3	Q3E790	80 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	GAT4	P40569	121 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	IGD1	P43598	195 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	OST2	P46964	130 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CPR4	YCR069W	SMP1	P38128	452 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CPR4	YCR069W	YAR1	P46683	200 aa		3.02	□□□□□ -1.93

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