RNA–Protein interactions for RNA: YBL037W

APL3, Transcript of Alpha-adaptin, yeast

Gene APL3, Length 3,078 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APL3	YBL037W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.51	□□□□□ -2.33	not detected
APL3	YBL037W	ICS3	P47034	131 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	AIM36	Q03798	255 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YDR029W	Q12111	104 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	RTC6	O14464	93 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	PAU2	P32612	120 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	PAU24	P38155	120 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YGL149W	P53116	101 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	SAE3	P89114	91 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	APS2	Q00381	147 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	GPI19	Q04082	140 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	MIX14	Q04341	121 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	COA4	Q05809	96 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	BPH1	P25356	2167 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YKL044W	P36092	106 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	ERV14	P53173	138 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	SEN15	Q04675	128 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	SEC59	P20048	519 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YBR090C	P38253	122 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	RPB11	P38902	120 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	GTT1	P40582	234 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	LCL2	Q08045	131 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	RRT15	Q3E811	62 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	CCW14	O13547	238 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	PAU15	P40585	124 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	PAM16	P42949	149 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	PAU23	Q07987	124 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	FIT3	Q08907	204 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	PAU17	Q12370	124 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YCR099C	P25657	155 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	MIC27	P50945	234 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	PRM3	Q08931	133 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	TAO3	P40468	2376 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YLR194C	Q05777	254 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	TOM6	P33448	61 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	TDA2	P40045	126 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	HPA2	Q06592	156 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	MIC10	Q96VH5	97 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	PAU19	P0CE85	124 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	PAU3	P25610	124 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YCR085W	P25650	117 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YMR141C	P40211	102 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	BLM10	P43583	2143 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YFR035C	P43608	114 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	POR2	P40478	281 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YOR343C	Q12484	108 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	OST5	Q92316	86 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APL3	YBL037W	COX23	P38824	151 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YEA6	P39953	335 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	HHY1	P39982	102 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	PAU5	P43575	122 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	TOS6	P48560	102 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	ZEO1	Q08245	113 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YOL118C	Q08259	102 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	PCC1	Q3E833	88 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YAL065C	O13511	128 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	ROX3	P25046	220 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	SRX1	P36077	127 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	IRA1	P18963	3092 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	UBC5	P15732	148 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	PAU16	P35994	123 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YBR013C	P38215	129 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	CYB5	P40312	120 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	YIL163C	P40448	117 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	VMA21	P41806	77 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	MVB12	P42939	101 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APL3	YBL037W	HOR7	Q05827	59 aa		0.45	□□□□□ -2.34

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