RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641867.1

CASC19-262, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 866 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-262	ENST00000641867	PGK2	P07205	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	PFKM	P08237	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	MYL3	P08590	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	AKR1A1	P14550	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	ACRV1	P26436	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	CCR10	P46092	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	RGS3	P49796	1198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	GPR85	P60893	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	CCNA1	P78396	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	LSAMP	Q13449	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	CLMP	Q9H6B4	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	FBN2	P35556	2912 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	CTAGE5	O15320	804 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	IL33	O95760	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	BDNF	P23560	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	SERPINB3	P29508	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	MAN1A1	P33908	653 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63	3e-6	■■□□□ 12.9
CASC19-262	ENST00000641867	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	KALRN	O60229	2985 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	PMM2	O15305	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	NCK2	O43639	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	CUTA	O60888	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	KCNK5	O95279	499 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	CKM	P06732	381 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	CR2	P20023	1033 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	AKAP5	P24588	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	LMO1	P25800	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	HAL	P42357	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	AK2	P54819	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	BACE1	P56817	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	COASY	Q13057	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	PAK1	Q13153	545 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	GALE	Q14376	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	GPNMB	Q14956	572 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	ODF1	Q14990	250 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-262	ENST00000641867	ALF	Q53S48	1182 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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