RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637307.1

POLG-223, Transcript of DNA polymerase gamma, catalytic subunit, human

TSL 5

Gene POLG, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLG-223	ENST00000637307	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
POLG-223	ENST00000637307	PTPRB	P23467	1997 aa		10.65	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	ITPR1	Q14643	2758 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	KLRC4	O43908	158 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	HUS1	O60921	280 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	PPP6R2	O75170	966 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	YEATS4	O95619	227 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	CYP17A1	P05093	508 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	KRT19	P08727	400 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	DGKE	P52429	567 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	SLC7A9	P82251	487 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	RBP5	P82980	135 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	MYL7	Q01449	175 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	CYP24A1	Q07973	514 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	FOXC1	Q12948	553 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	DPH6	Q7L8W6	267 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	WDR49	Q8IV35	697 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	DHX58	Q96C10	678 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	PCED1B	Q96HM7	432 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	HPDL	Q96IR7	371 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	CGRRF1	Q99675	332 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	RNF38	Q9H0F5	515 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	HCN2	Q9UL51	889 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	INVS	Q9Y283	1065 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		10.64	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	CACNA1G	O43497	2377 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	TAF4	O00268	1085 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	TNFRSF10B	O14763	440 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	ADAM23	O75077	832 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	IFNAR2	P48551	515 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	LHX1	P48742	406 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	CASP4	P49662	377 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	PSMD6	Q15008	389 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	STK38	Q15208	465 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	TAF12	Q16514	161 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	UNC13D	Q70J99	1090 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	C12orf40	Q86WS4	652 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	FRMD1	Q8N878	549 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	EXOC4	Q96A65	974 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	SDCBP2	Q9H190	292 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	CDH9	Q9ULB4	789 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		10.63	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	UBE4B	O95155	1302 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	SGK1	O00141	431 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	LEFTY2	O00292	366 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	CLIC2	O15247	247 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	CUTA	O60888	179 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	TACC1	O75410	805 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	NFATC1	O95644	943 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	HDC	P19113	662 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	BDNF	P23560	247 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	PCSK1	P29120	753 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	PTGER3	P43115	390 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	ASIC1	P78348	528 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	NR1H3	Q13133	447 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	CUL4B	Q13620	913 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	DHCR24	Q15392	516 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	RESP18	Q5W5W9	173 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	ANO7	Q6IWH7	933 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		10.62	□□□□□ -0.71
POLG-223	ENST00000637307	VSTM1	Q6UX27	236 aa		10.62	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms