RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC7A9P82251 487 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 RABEP1Q15276 862 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 EMC10Q5UCC4 262 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 USP49Q70CQ1 688 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SV2BQ7L1I2 683 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 DPH6Q7L8W6 267 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MMS19Q96T76 1030 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM74BQ9NUR3 256 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF840PA6NDX5 716 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 DPP6P42658 865 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 CASP5P51878 434 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MESP2Q0VG99 397 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 RRAGBQ5VZM2 374 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 BRAPQ7Z569 592 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 C12orf40Q86WS4 652 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 HDDC3Q8N4P3 179 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF38Q9H0F5 515 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 THADAQ6YHU6 1953 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ADH5P11766 374 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MDH1BQ5I0G3 518 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 HS2ST1Q7LGA3 356 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 GPD1LQ8N335 351 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP295NLQ96MC4 621 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 INTS13Q9NVM9 706 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 F8VP50 259 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TXLNAP40222 546 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIA2P42262 883 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP3CCP48454 512 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ALCAMQ13740 583 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5B17Q8NGF7 314 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PCED1BQ96HM7 432 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TTLL2Q9BWV7 592 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX25Q9H3E2 840 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 FSCN3Q9NQT6 498 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK13Q9UKR3 277 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO16Q9Y6X6 1858 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP205Q92621 2012 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 BAHCC1Q9P281 2608 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 WARSP23381 471 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ITPKAP23677 461 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP7D1Q3KQU3 841 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 RHBDF2Q6PJF5 856 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC19Q96DA6 116 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SLITRK1Q96PX8 696 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 OLFML3Q9NRN5 406 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 LHX6Q9UPM6 363 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 RDXP35241 583 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF10Q12962 218 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC23A3Q6PIS1 610 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB119Q8N690 84 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1958Q8N8K9 716 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRJQ12913 1337 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D3BA6NDS4 549 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 AP5Z1O43299 807 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 OAS1P00973 400 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF4P43489 277 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 NOP14P78316 857 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 DUOXA2Q1HG44 320 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SPDYCQ5MJ68 293 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 BTBD8Q5XKL5 378 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf48Q96LL4 319 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D14Q9P2M4 693 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PILRBQ9UKJ0 227 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC6A14Q9UN76 642 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MSRB2Q9Y3D2 182 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF233A6NK53 670 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAM23O75077 832 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 OLFM2O95897 454 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 RING1Q06587 406 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ACAP1Q15027 740 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SURF1Q15526 300 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 DUOXA1Q1HG43 343 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 LY6G5CQ5SRR4 150 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 LIMS2Q7Z4I7 341 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 NAT16Q8N8M0 369 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6B3Q8NGW1 331 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP76Q8TAP6 659 aa29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms