RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 EPC2Q52LR7 807 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 XKR5Q6UX68 686 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 LPCAT2Q7L5N7 544 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ACAP3Q96P50 834 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHB18PQ96TA0 734 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 AGPAT1Q99943 283 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 EBF4Q9BQW3 602 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 DRC3Q9H069 523 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 NHSQ6T4R5 1651 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 STRNO43815 780 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 MAGEC1O60732 1142 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJA2O60884 412 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ALDH2P05091 517 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 POLR2MP0CAP2 368 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SLC12A3P55017 1021 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CDH15P55291 814 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TFDP1Q14186 410 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 HIC1Q14526 733 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CYP1B1Q16678 543 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC43Q8N309 656 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF276Q8N554 614 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 GPR88Q9GZN0 384 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC19Q9H756 370 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 EYSQ5T1H1 3165 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SGPL1O95470 568 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CRTAMO95727 393 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 IFNB1P01574 187 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 PROCP04070 461 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SHMT1P34896 483 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CRKP46108 304 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 GPC5P78333 572 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 POTEHQ6S545 545 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SIX5Q8N196 739 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA17Q96L03 361 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SNX27Q96L92 541 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CFAP57Q96MR6 1250 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R16BQ96T49 567 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 MYH11P35749 1972 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TCEA3O75764 348 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 THRAP10827 490 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 RALAP11233 206 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 IL1R1P14778 569 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 AQP5P55064 265 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 EEPD1Q7L9B9 569 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 FBXO11Q86XK2 927 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ATP2A3Q93084 1043 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 NEURL2Q9BR09 285 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 DCLK3Q9C098 648 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CROTQ9UKG9 612 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SCN7AQ01118 1682 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 FAM86B1E9PN63 330 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 PIK3R2O00459 728 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SOCS7O14512 581 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 SNHG28P0DPA3 235 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 BMP3P12645 472 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 ALDH1A3P47895 512 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 CDKL1Q00532 357 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 PTK6Q13882 451 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 KRT72Q14CN4 511 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 C16orf87Q6PH81 154 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRT-211ENST00000618610 PACS1Q6VY07 963 aa8.53□□□□□ -1.04
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