RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 EXT2Q93063 718 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 LXNQ9BS40 222 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 HPSEQ9Y251 543 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DPYSL4O14531 572 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF862O60290 1169 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ANPEPP15144 967 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 COMTP21964 271 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 MTA1Q13330 715 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ACCSLQ4AC99 568 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DHDDSQ86SQ9 333 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 NAT14Q8WUY8 206 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SELENONQ9NZV5 590 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CENPXA8MT69 81 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 M0QYV0 167 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SNPHO15079 494 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RGS5O15539 181 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D12O60347 775 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PGM3O95394 542 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF23P17027 643 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 FASP25445 335 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RAB27AP51159 221 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 KCNK10P57789 538 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 POU5F1BQ06416 359 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TSC22D1Q15714 1073 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PRMT9Q6P2P2 845 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 MOXD1Q6UVY6 613 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 IKBIPQ70UQ0 350 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 FAM162AQ96A26 154 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PHF21AQ96BD5 680 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SPATA33Q96N06 139 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RIT2Q99578 217 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 KLHL3Q9UH77 587 aa7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PSEN1P49768 467 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 NCALDP61601 193 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RBP5P82980 135 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TRAF3Q13114 568 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 NUP93Q8N1F7 819 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 EPAS1Q99814 870 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RRN3P2A6NIE6 340 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RNF103O00237 685 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CLOCKO15516 846 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 GRIN3BO60391 1043 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ALDH1A3P47895 512 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RAD23AP54725 363 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 COG2Q14746 738 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 AGR3Q8TD06 166 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DCCP43146 1447 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 H3BNX3 289 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 MTSS1O43312 755 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 GH1P01241 217 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 GCLMP48507 274 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 CDK7P50613 346 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 ACTR2P61160 394 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM270Q6UE05 265 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 KRT73Q86Y46 540 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 TAGAPQ8N103 731 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PDPRQ8NCN5 879 aa7.11□□□□□ -1.27
CLCN3-211ENST00000613795 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms