RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 MED24O75448 989 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 SUPT7LO94864 414 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 CTSHP09668 335 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 MLNP12872 115 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 GLMNQ92990 594 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 IMPAD1Q9NX62 359 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 M0QYT0 321 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 STK25O00506 426 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 RPS6KA5O75582 802 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 TTI2Q6NXR4 508 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 RMND5AQ9H871 391 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 BGNP21810 368 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 NCALDP61601 193 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 SLC24A2Q9UI40 661 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 SOX13Q9UN79 622 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 CFAP99D6REC4 459 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 FKBP6O75344 327 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 UBOX5O94941 541 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 CAMTA2O94983 1202 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 MGAT5BQ3V5L5 792 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 C11orf63Q6NUN7 778 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 NOTUMQ6P988 496 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP12.37□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 45.5
TNS1-220ENST00000611415 TADA1Q96BN2 335 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 ATP9AO75110 1047 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 PMPCBO75439 489 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 HARS2P49590 506 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 TAF6P49848 677 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 OTOAQ7RTW8 1153 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 YIPF2Q9BWQ6 316 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 KANSL1LA0AUZ9 987 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 RASSF9O75901 435 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 EPHB2P29323 1055 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 GALNTL6Q49A17 601 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 RIN3Q8TB24 985 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 JADE3Q92613 823 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 ERAP1Q9NZ08 941 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 STMN3Q9NZ72 180 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 IQSEC2Q5JU85 1478 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 PYGMP11217 842 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 CHRNB3Q05901 458 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 TP53BP2Q13625 1128 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 IZUMO2Q6UXV1 221 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 CHSY1Q86X52 802 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 GPRASP2Q96D09 838 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 ZBTB10Q96DT7 871 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 TAAR1Q96RJ0 339 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 CRLS1Q9UJA2 301 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 GIT2Q14161 759 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 C11orf74Q86VG3 221 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 ZFP42Q96MM3 310 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 LRRC40Q9H9A6 602 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 SPASTQ9UBP0 616 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 SLCO1B7G3V0H7 640 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 KCNQ2O43526 872 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 TOMM70O94826 608 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 NFYCQ13952 458 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 OASLQ15646 514 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 C10orf120Q5SQS8 335 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 MRNIPQ6NTE8 343 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 LRRC8DQ7L1W4 858 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 MICALL2Q8IY33 904 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 ZNRF3Q9ULT6 936 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 C2orf81A6NN90 581 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 PIK3CDO00329 1044 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 VDRP11473 427 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 CHST13Q8NET6 341 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 EXD1Q8NHP7 514 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 USP32Q8NFA0 1604 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 F8VZ95 297 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 PEX5P50542 639 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 NME5P56597 212 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 KCNT1Q5JUK3 1230 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 SLC26A11Q86WA9 606 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 PRIM2P49643 509 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 CASP4P49662 377 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 CCNG2Q16589 344 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-220ENST00000611415 WASHC2DQ5SRD0 308 aa12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms