RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606828.2

MED16-211, Transcript of mediator complex subunit 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MED16, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16-211ENST00000606828 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.5□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 CACNA1HO95180 2353 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 SHISA7A6NL88 538 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 TNFRSF10BO14763 440 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 PMM2O15305 246 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 ADORA2BP29275 332 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 MAP3K7CLP57077 242 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 TNK2Q07912 1038 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 CUL2Q13617 745 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 MTF1Q14872 753 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 PDGFRLQ15198 375 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 ZNF394Q53GI3 561 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 TTC16Q8NEE8 873 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 TTC8Q8TAM2 541 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 TATDN2Q93075 761 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 FBXO32Q969P5 355 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 CLDN23Q96B33 292 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 SMOQ99835 787 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 ARID3AQ99856 593 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 IL37Q9NZH6 218 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 P4HA2O15460 535 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 BEST1O76090 585 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 CCDC192P0DO97 292 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 CTHP32929 405 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 SOX9P48436 509 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 AMPD2Q01433 879 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 RUNX3Q13761 415 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 ZNF77Q15935 545 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 MLKLQ8NB16 471 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 GBP4Q96PP9 640 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 EBF3Q9H4W6 596 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.48□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 PIEZO1Q92508 2521 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 COL4A3Q01955 1670 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 FAM92AA1XBS5 289 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 OLFM2O95897 454 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 TCF3P15923 654 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 RAD23BP54727 409 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 SLC7A9P82251 487 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 LRMPQ12912 555 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 USP4Q13107 963 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 FZD5Q13467 585 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 RIN3Q8TB24 985 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 NT5C1BQ96P26 610 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 DUSP16Q9BY84 665 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 RNF38Q9H0F5 515 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 LAMTOR5O43504 91 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 IFNAR2P48551 515 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 TUBP50607 506 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 SLC8A3P57103 927 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 KCNH2Q12809 1159 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 LRRC32Q14392 662 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 HECTD3Q5T447 861 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 CPA6Q8N4T0 437 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 ATP2A3Q93084 1043 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 IER2Q9BTL4 223 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 HPS4Q9NQG7 708 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 GMIPQ9P107 970 aa14.46□□□□□ -0.09
MED16-211ENST00000606828 CPQQ9Y646 472 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms