RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592763.5

ILF3-222, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ILF3, Length 3,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-222	ENST00000592763	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	ABLIM1	O14639	778 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	SPTLC1	O15269	473 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	PSTPIP1	O43586	416 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	CHRNA1	P02708	482 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	ITGA8	P53708	1063 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	TFDP2	Q14188	446 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	KYNU	Q16719	465 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	GPR152	Q8TDT2	470 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	KCNN4	O15554	427 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	IFNAR2	P48551	515 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	DEFB106A	Q8N104	65 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	KCNK16	Q96T55	309 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	CD48	P09326	243 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	NDUFV1	P49821	464 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	GNGT1	P63211	74 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	AP1B1	Q10567	949 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	EXD1	Q8NHP7	514 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59	1e-8	■□□□□ 8.4
ILF3-222	ENST00000592763		Q9Y3F1	56 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	OGDH	Q02218	1023 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	XYLT1	Q86Y38	959 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	FAF2	Q96CS3	445 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	B3GALT6	Q96L58	329 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	FAM189A1	O60320	539 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	GPD2	P43304	727 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	SLC6A3	Q01959	620 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	SLC29A2	Q14542	456 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	SNF8	Q96H20	258 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		11.33	□□□□□ -0.59
ILF3-222	ENST00000592763	TRAPPC3	O43617	180 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	DNAJB2	P25686	324 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	HSD17B3	P37058	310 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	NPNT	Q6UXI9	565 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	ARL8A	Q96BM9	186 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	MIOS	Q9NXC5	875 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	PSME4	Q14997	1843 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	LRCH4	O75427	683 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	APRT	P07741	180 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	LHX1	P48742	406 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	ITK	Q08881	620 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	BFSP2	Q13515	415 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	TTC27	Q6P3X3	843 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	MYO9B	Q13459	2157 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	APOL1	O14791	398 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	CABYR	O75952	493 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	PEX5	P50542	639 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	ROR1	Q01973	937 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	ITIH3	Q06033	890 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	MTFR1	Q15390	333 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	EFHC2	Q5JST6	749 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	ALS2CL	Q60I27	953 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ILF3-222	ENST00000592763	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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