RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 USP41Q3LFD5 358 aa20.7■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 RAB41Q5JT25 222 aa20.7■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.7■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.7■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 RXFP2Q8WXD0 754 aa20.7■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 HERVK_113Q902F9 699 aa20.7■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CHST7Q9NS84 486 aa20.7■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.7■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 PDGFRAP16234 1089 aa20.69■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 LAG3P18627 525 aa20.69■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ARPP19P56211 112 aa20.69■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.69■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.69■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.69■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 H7C4K7 107 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CEP104O60308 925 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 DPF3Q92784 378 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 TMEM169Q96HH4 297 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CARD9Q9H257 536 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 SOD2P04179 222 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 GPD1P21695 349 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 SCNN1AP37088 669 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CCDC181Q5TID7 509 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 AADACL2Q6P093 401 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 SPG21Q9NZD8 308 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 RNF14Q9UBS8 474 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 INSL6Q9Y581 213 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 PTPRDP23468 1912 aa20.68■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 LRCH4O75427 683 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 TADA3O75528 432 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 LINC00271P0C7V0 271 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 PYGMP11217 842 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 GRIK1P39086 918 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 TERF1P54274 439 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CCDC14Q49A88 953 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.67■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 C2CD2LO14523 706 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ADAM12O43184 909 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CTAGE8P0CG41 777 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CPB1P15086 417 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.93e-7■■■■■ 33.8
PGS1-211ENST00000589425 PAFAH1B1P43034 410 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 RWDD2BP57060 319 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 GPR17Q13304 367 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 RAB6CQ53S08 254 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 FIBCD1Q8N539 461 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ABHD8Q96I13 439 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 CNPY3Q9BT09 278 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 MTRRQ9UBK8 725 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 VNN2O95498 520 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 USP17L7P0C7H9 530 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 DAOAP59103 153 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 PSMD5Q16401 504 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ARCQ7LC44 396 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PGS1-211ENST00000589425 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
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