RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CEP83Q9Y592 693 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.63□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 A0A087WZ62 844 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 BICDL2A1A5D9 508 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CSF1RP07333 972 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PPP3CBP16298 524 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 MAKP20794 623 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 TECP42680 631 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 KRTAP10-2P60368 255 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 FSTL1Q12841 308 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 KRT73Q86Y46 540 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PGBD1Q96JS3 809 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SNX27Q96L92 541 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 MLST8Q9BVC4 326 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 STK33Q9BYT3 514 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 COL4A3Q01955 1670 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CLGNO14967 610 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ITGAMP11215 1152 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 GABRB3P28472 473 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PDE6CP51160 858 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 MAPK10P53779 464 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PRKAG1P54619 331 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 STK3Q13188 491 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ERAP2Q6P179 960 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 MZT2AQ6P582 158 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SPARTQ8N0X7 666 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 LPIN2Q92539 896 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 LRRC46Q96FV0 321 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PIAS2O75928 621 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 RASAL1O95294 804 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 IDEP14735 1019 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SCP2P22307 547 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CASP2P42575 452 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 BCAT1P54687 386 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 TNFAIP2Q03169 654 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CCNIQ14094 377 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PTPRRQ15256 657 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ALFQ53S48 1182 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ERP27Q96DN0 273 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 FAM227BQ96M60 508 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 Q96MF0 132 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 COQ10AQ96MF6 247 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ZNF69Q9UC07 566 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 POLG2Q9UHN1 485 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CDC23Q9UJX2 597 aa6.6□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 MAST3O60307 1309 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 A0A087WV62 115 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 F5H423 210 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PPM1DO15297 605 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 RGS10O43665 173 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 TLR5O60602 858 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 INSRRP14616 1297 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 TGM1P22735 817 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PRKAR1BP31321 381 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 FOLR3P41439 243 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 MANEALQ5VSG8 457 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ANO1Q5XXA6 986 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.59□□□□□ -1.35
TSG101-211ENST00000580814 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms