RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	PLA2R1	Q13018	1463 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.21	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		4.21	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084		A1L4Q6	167 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084		H0YIZ8	118 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	ORC4	O43929	436 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	GPD1	P21695	349 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	ADORA2A	P29274	412 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	FMO1	Q01740	532 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	E2F2	Q14209	437 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	DPF1	Q92782	380 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	NELL1	Q92832	810 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.21	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	ABCA8	O94911	1581 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	ATP10A	O60312	1499 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	NXPH3	O95157	252 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	C1R	P00736	705 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	FES	P07332	822 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	MYF5	P13349	255 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	YY1	P25490	414 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	CD38	P28907	300 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	FOXF2	Q12947	444 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	RAB32	Q13637	225 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	CNGA2	Q16280	664 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	APIP	Q96GX9	242 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	MYO1C	O00159	1063 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	TJP3	O95049	919 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	ONECUT2	O95948	504 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	IL1R1	P14778	569 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	RHCE	P18577	417 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	ATF3	P18847	181 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	PDE6C	P51160	858 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	RHD	Q02161	417 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	NPY5R	Q15761	445 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.19	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	LRP5	O75197	1615 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.18	□□□□□ -1.74
COX11-208	ENST00000576084	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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