RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567228.1

E2F4-209, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 757 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-209ENST00000567228 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.56■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 FUKQ8N0W3 1084 aa20.56■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 NUP93Q8N1F7 819 aa20.56■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.56■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 HINFPQ9BQA5 517 aa20.56■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 LEFTY2O00292 366 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 AKAP3O75969 853 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ZNF202O95125 648 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 DRD1P21728 446 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 PDE6CP51160 858 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 WDR5BQ86VZ2 330 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 CPA6Q8N4T0 437 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 TAF4BQ92750 862 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ATP2A3Q93084 1043 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa20.54■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ASPAP45381 313 aa20.54■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 IFNAR2P48551 515 aa20.54■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 PPP3CAQ08209 521 aa20.54■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 CEP135Q66GS9 1140 aa20.54■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.54■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 FAM35AQ86V20 835 aa20.54■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.54■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 TNIP3Q96KP6 325 aa20.54■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.54■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.54■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.54■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 RNF40O75150 1001 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 BEST1O76090 585 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 HLA-DRAP01903 254 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 YWHAQP27348 245 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 OPRD1P41143 372 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 VAMP7P51809 220 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ENPEPQ07075 957 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 LPAL2Q16609 132 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 FBXO43Q4G163 708 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ACOT1Q86TX2 421 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 UNC93AQ86WB7 457 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 SMOQ99835 787 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ATG13O75143 517 aa20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 RETP07949 1114 aa20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 NR2F2P24468 414 aa20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 PGFP49763 221 aa20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 NDST1P52848 882 aa20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 CD101Q93033 1021 aa20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 COMMD8Q9NX08 183 aa20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 CPQQ9Y646 472 aa20.52■□□□□ 0.88
E2F4-209ENST00000567228 ANTXRLA6NF34 631 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 KIF20AO95235 890 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 INCA1Q0VD86 236 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 C12orf29Q8N999 325 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 TTC16Q8NEE8 873 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 TWNKQ96RR1 684 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 K7EQS6 105 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 COCHO43405 550 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 NFATC1O95644 943 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 P4HA1P13674 534 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 CCDC130P13994 396 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 GCLMP48507 274 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 SLC5A3P53794 718 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 NR1H3Q13133 447 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 ORC1Q13415 861 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 SYT13Q7L8C5 426 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F4-209ENST00000567228 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms