RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS2-205	ENST00000558843	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
COPS2-205	ENST00000558843	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS2-205	ENST00000558843	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS2-205	ENST00000558843	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	TLR2	O60603	784 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	FGA	P02671	866 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	PLS1	Q14651	629 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	PIM3	Q86V86	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843		B4DGG1	531 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843		H3BUI4	141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	ME1	P48163	572 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	USP45	Q70EL2	814 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	CES2	O00748	559 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	MT-CO3	P00414	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	CFHR1	Q03591	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	KRT17	Q04695	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	SEC23B	Q15437	767 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	NPY5R	Q15761	445 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	PHKG2	P15735	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	KCNA3	P22001	575 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	GK	P32189	559 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	DGKE	P52429	567 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	UCP3	P55916	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	AMPD3	Q01432	767 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	TULP3	O75386	442 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	PMPCB	O75439	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	CTSA	P10619	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	CYP2C9	P11712	490 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	WNT3	P56703	355 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	LMAN2	Q12907	356 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	MLC1	Q15049	377 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843		Q6ZTC4	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	TNKS	O95271	1327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	SLC11A2	P49281	568 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	PRKAG1	P54619	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS2-205	ENST00000558843	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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