RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 EVPLQ92817 2033 aa23.64■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 P4HA1P13674 534 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 KRT4P19013 534 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ARHGAP1Q07960 439 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 CCDC15Q0P6D6 951 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 INCA1Q0VD86 236 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 PAFAH2Q99487 392 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 RSAD1Q9HA92 442 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 PIK3R2O00459 728 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ENDOD1O94919 500 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 LGALS2P05162 132 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 NDST1P52848 882 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 DPYSL3Q14195 570 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 TMEM132DQ14C87 1099 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 BBS9Q3SYG4 887 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ADGRD1Q6QNK2 874 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ASRGL1Q7L266 308 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 KIF2BQ8N4N8 673 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 MZB1Q8WU39 189 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 CNPY3Q9BT09 278 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 C2CD4BA6NLJ0 364 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 FGFR1P11362 822 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 GPD1P21695 349 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 BASP1P80723 227 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 RIPK1Q13546 671 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 PDIK1LQ8N165 341 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 KLHL29Q96CT2 875 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 AKT3Q9Y243 479 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 EDF1O60869 148 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 VTNP04004 478 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 CDH6P55285 790 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 NOMO1Q15155 1222 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 KLHL38Q2WGJ6 581 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 WLSQ5T9L3 541 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 RXFP2Q8WXD0 754 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 MROH8Q9H579 483 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ARHGEF3Q9NR81 526 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 TRIM33Q9UPN9 1127 aa23.62■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 E5RJQ4 531 aa23.61■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 SMAPO00193 183 aa23.61■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ROR1Q01973 937 aa23.61■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 LVRNQ6Q4G3 990 aa23.61■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 CEP57Q86XR8 500 aa23.61■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 LRRC8CQ8TDW0 803 aa23.61■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 DCAKDQ8WVC6 231 aa23.61■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 TSPAN16Q9UKR8 245 aa23.61■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 PFKMP08237 780 aa23.6■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 CCNB1P14635 433 aa23.6■■□□□ 1.37
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RCCD1-208ENST00000557266 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
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RCCD1-208ENST00000557266 LCLAT1Q6UWP7 414 aa23.6■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ARMCX2Q7L311 632 aa23.6■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 IGDCC3Q8IVU1 814 aa23.6■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ITGA11Q9UKX5 1188 aa23.6■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.6■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ZWINTO95229 277 aa23.6■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 KRT16P08779 473 aa23.6■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 PPIL2Q13356 520 aa23.6■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 OR6B2Q6IFH4 312 aa23.6■■□□□ 1.37
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RCCD1-208ENST00000557266 PALM2Q8IXS6 379 aa23.6■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23.6■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 GRAP2O75791 330 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 SLC8A1P32418 973 aa23.59■■□□□ 1.37
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RCCD1-208ENST00000557266 C12orf29Q8N999 325 aa23.59■■□□□ 1.37
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RCCD1-208ENST00000557266 MYLK2Q9H1R3 596 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 DPP3Q9NY33 737 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 CHKBQ9Y259 395 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 C2CD2Q9Y426 696 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ASB14A6NK59 587 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF286BP0CG31 522 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 TSHRP16473 764 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 OSBPP22059 807 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 STIP1P31948 543 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 RBP5P82980 135 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 KCNJ11Q14654 390 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 CDO1Q16878 200 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 FAM182AQ5T1J6 154 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 USH1CQ9Y6N9 552 aa23.59■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.58■■□□□ 1.37
RCCD1-208ENST00000557266 TSPAN1O60635 241 aa23.58■■□□□ 1.37
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