RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553301.1

AL845552.2-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AL845552.2, Length 553 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL845552.2-201ENST00000553301 TUBP50607 506 aa22.2■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 SLC7A9P82251 487 aa22.2■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 USP4Q13107 963 aa22.2■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 LRRC32Q14392 662 aa22.2■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 MTF1Q14872 753 aa22.2■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 CAMK4Q16566 473 aa22.2■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.2■■□□□ 1.14
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AL845552.2-201ENST00000553301 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.19■■□□□ 1.14
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AL845552.2-201ENST00000553301 SLC8A3P57103 927 aa22.19■■□□□ 1.14
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AL845552.2-201ENST00000553301 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.19■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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AL845552.2-201ENST00000553301 GKN1Q9NS71 199 aa22.19■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 COL4A2P08572 1712 aa22.19■■□□□ 1.14
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AL845552.2-201ENST00000553301 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.18■■□□□ 1.14
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AL845552.2-201ENST00000553301 ATP2A3Q93084 1043 aa22.18■■□□□ 1.14
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AL845552.2-201ENST00000553301 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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AL845552.2-201ENST00000553301 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.16■■□□□ 1.14
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AL845552.2-201ENST00000553301 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.16■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.16■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 TATDN2Q93075 761 aa22.16■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 SLC22A12Q96S37 553 aa22.16■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 DUSP16Q9BY84 665 aa22.16■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.16■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 LRRN2O75325 713 aa22.15■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.15■■□□□ 1.14
AL845552.2-201ENST00000553301 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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