RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	SYT1	P21579	422 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	ANXA13	P27216	316 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC6A11	P48066	632 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	CRY1	Q16526	586 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	ALLC	Q8N6M5	410 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	ABL1	P00519	1130 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	TAF10	Q12962	218 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC39A14	Q15043	492 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	DHCR24	Q15392	516 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	SURF1	Q15526	300 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	C11orf74	Q86VG3	221 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	TTC30A	Q86WT1	665 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	FRMD1	Q8N878	549 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	RLN3	Q8WXF3	142 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	SGK1	O00141	431 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	CLDN5	O00501	218 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	TACC1	O75410	805 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	KAT7	O95251	611 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	TIE1	P35590	1138 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	IRX4	P78413	519 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	KDSR	Q06136	332 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	E2F4	Q16254	413 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	EMC10	Q5UCC4	262 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	PNKP	Q96T60	521 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	EHD2	Q9NZN4	543 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	WASF3	Q9UPY6	502 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	PROS1	P07225	676 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	C1QTNF9	P0C862	333 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	TNNI1	P19237	187 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	SPINK2	P20155	84 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	P2RY2	P41231	377 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP3CC	P48454	512 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXC1	Q12948	553 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF516	Q92618	1163 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	PIGK	Q92643	395 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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