RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 FAM26DQ5JW98 314 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 PAQR9Q6ZVX9 377 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 FBXO25Q8TCJ0 367 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 B3GALT6Q96L58 329 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 CNPY3Q9BT09 278 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 RGS18Q9NS28 235 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 PHF24Q9UPV7 400 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 ZNF148Q9UQR1 794 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 H3BQF6 201 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 CST8O60676 142 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 TJP3O95049 919 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 KRT7P08729 469 aa8.83□□□□□ -1
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CS-215ENST00000549143 CDH6P55285 790 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 PRMT2P55345 433 aa8.83□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 KRT17Q04695 432 aa8.83□□□□□ -1
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CS-215ENST00000549143 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.83□□□□□ -1
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CS-215ENST00000549143 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.83□□□□□ -1
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CS-215ENST00000549143 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
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CS-215ENST00000549143 ODC1P11926 461 aa8.82□□□□□ -1
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CS-215ENST00000549143 METTL23Q86XA0 190 aa8.82□□□□□ -1
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CS-215ENST00000549143 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.82□□□□□ -1
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CS-215ENST00000549143 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 PCYOX1Q9UHG3 505 aa8.82□□□□□ -1
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CS-215ENST00000549143 CDH23Q9H251 3354 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 ATP8B1O43520 1251 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 KRT14P02533 472 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 SETSIPP0DME0 302 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 ADCY8P40145 1251 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 CDKN2BP42772 138 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 PTGIRP43119 386 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 ARPP19P56211 112 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 SNX16P57768 344 aa8.82□□□□□ -1
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CS-215ENST00000549143 FAM131BQ86XD5 332 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 RFX6Q8HWS3 928 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 STKLD1Q8NE28 680 aa8.82□□□□□ -1
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CS-215ENST00000549143 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 RUFY1Q96T51 708 aa8.82□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 FMO2Q99518 471 aa8.82□□□□□ -1
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