RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R16AQ96I34 528 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZFYVE19Q96K21 471 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 DEPDC5O75140 1603 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MTA2O94776 668 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CRTAMO95727 393 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CCR1P32246 355 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SCNN1GP51170 649 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 POU4F1Q01851 419 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TROAPQ12815 778 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 C10orf53Q8N6V4 93 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 KLHL29Q96CT2 875 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ELOVL4Q9GZR5 314 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 DTNAQ9Y4J8 743 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 IGSF6O95976 241 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 COMTP21964 271 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FICDQ9BVA6 458 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 DCLK3Q9C098 648 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RNF112Q9ULX5 631 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GOLGA8RI6L899 631 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CXCL14O95715 111 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TM4SF1P30408 202 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SERPINB9P50453 376 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NAB2Q15742 525 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SNCBQ16143 134 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 BOLA3Q53S33 107 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NIPA1Q7RTP0 329 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CERS4Q9HA82 394 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PCMTD2Q9NV79 361 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SETSIPP0DME0 302 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TNNI3P19429 210 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SCNN1BP51168 640 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ADIGQ0VDE8 80 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 VMP1Q96GC9 406 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 APPL1Q9UKG1 709 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 VPS26AO75436 327 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MRNIPQ6NTE8 343 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RASGRP2Q7LDG7 609 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 JADE3Q92613 823 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NEU2Q9Y3R4 380 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SOAT2O75908 522 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM16O95361 564 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 OR1E1P30953 314 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZSCAN26Q16670 478 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 USP41Q3LFD5 358 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SLC20A1Q8WUM9 679 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CYTH2Q99418 400 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CLPBQ9H078 707 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ATP13A1Q9HD20 1204 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ESYT3A0FGR9 886 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MLNP12872 115 aa9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms