RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 PPP2R2AP63151 447 aa7.9□□□□□ -1.14
PACS1-211ENST00000531298 MGAT3Q09327 533 aa7.9□□□□□ -1.14
PACS1-211ENST00000531298 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.9□□□□□ -1.14
PACS1-211ENST00000531298 NOGQ13253 232 aa7.9□□□□□ -1.14
PACS1-211ENST00000531298 PTK7Q13308 1070 aa7.9□□□□□ -1.14
PACS1-211ENST00000531298 CRHR2Q13324 411 aa7.9□□□□□ -1.14
PACS1-211ENST00000531298 DPYSL2Q16555 572 aa7.9□□□□□ -1.14
PACS1-211ENST00000531298 ZSCAN26Q16670 478 aa7.9□□□□□ -1.14
PACS1-211ENST00000531298 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.9□□□□□ -1.14
PACS1-211ENST00000531298 ZNF394Q53GI3 561 aa7.9□□□□□ -1.14
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PACS1-211ENST00000531298 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
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PACS1-211ENST00000531298 NT5C3BQ969T7 300 aa7.9□□□□□ -1.14
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PACS1-211ENST00000531298 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.9□□□□□ -1.14
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PACS1-211ENST00000531298 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
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PACS1-211ENST00000531298 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.9□□□□□ -1.14
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PACS1-211ENST00000531298 A8MXQ7 604 aa7.89□□□□□ -1.15
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PACS1-211ENST00000531298 MCF2LO15068 1137 aa7.89□□□□□ -1.15
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PACS1-211ENST00000531298 ITGA8P53708 1063 aa7.89□□□□□ -1.15
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PACS1-211ENST00000531298 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
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PACS1-211ENST00000531298 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 FAM228AQ86W67 206 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 TTC30AQ86WT1 665 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 IRGQQ8WZA9 623 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 RAPGEF5Q92565 580 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 P3H4Q92791 437 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 APBB2Q92870 758 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 LRRC39Q96DD0 335 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 PGBD4Q96DM1 585 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 RNF157Q96PX1 679 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
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PACS1-211ENST00000531298 EPN3Q9H201 632 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 SNX25Q9H3E2 840 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 AAASQ9NRG9 546 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.89□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 GRIN2DO15399 1336 aa7.88□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 A0A0U1RQF3 1178 aa7.88□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 C5orf60A6NFR6 353 aa7.88□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.88□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 HACD1B0YJ81 288 aa7.88□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 E5RJQ4 531 aa7.88□□□□□ -1.15
PACS1-211ENST00000531298 E7EVH7 732 aa7.88□□□□□ -1.15
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