RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531006.1

TSTA3-213, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-213ENST00000531006 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TSTA3-213ENST00000531006 CISHQ9NSE2 258 aa21.8■■□□□ 1.08
TSTA3-213ENST00000531006 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.8■■□□□ 1.08
TSTA3-213ENST00000531006 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.8■■□□□ 1.08
TSTA3-213ENST00000531006 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.8■■□□□ 1.08
TSTA3-213ENST00000531006 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.79■■□□□ 1.08
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TSTA3-213ENST00000531006 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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TSTA3-213ENST00000531006 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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TSTA3-213ENST00000531006 CPQQ9Y646 472 aa21.75■■□□□ 1.07
TSTA3-213ENST00000531006 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa21.75■■□□□ 1.07
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TSTA3-213ENST00000531006 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.74■■□□□ 1.07
TSTA3-213ENST00000531006 DUSP16Q9BY84 665 aa21.74■■□□□ 1.07
TSTA3-213ENST00000531006 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.74■■□□□ 1.07
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TSTA3-213ENST00000531006 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
TSTA3-213ENST00000531006 DMDP11532 3685 aa21.74■■□□□ 1.07
TSTA3-213ENST00000531006 USP34Q70CQ2 3546 aa21.74■■□□□ 1.07
TSTA3-213ENST00000531006 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-213ENST00000531006 COCHO43405 550 aa21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-213ENST00000531006 GNA14O95837 355 aa21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-213ENST00000531006 CALCAP01258 141 aa21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-213ENST00000531006 USP4Q13107 963 aa21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-213ENST00000531006 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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