RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526255.1

RCOR3-208, Transcript of REST corepressor 3, human

TSL 1 (best)

Gene RCOR3, Length 909 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCOR3-208	ENST00000526255	DDIT3	P35638	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	DGKE	P52429	567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	GGT6	Q6P531	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	POGK	Q9P215	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	PTPRT	O14522	1441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255		A0A1W2PS29	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255		H7C4K7	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	RAB27B	O00194	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	TRIM38	O00635	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	IRAK2	O43187	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	KCNA2	P16389	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	KCNA3	P22001	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	ZNF134	P52741	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	GRM1	Q13255	1194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	EDA	Q92838	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	FANCA	O15360	1455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	LEFTY2	O00292	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	PCDH17	O14917	1159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	ASNA1	O43681	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	SUN1	O94901	812 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	ZNF202	O95125	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCOR3-208	ENST00000526255	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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