RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521401.1

HOXA3-204, Transcript of homeobox A3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA3, Length 598 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-204ENST00000521401 PON2Q15165 354 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 ISM2Q6H9L7 571 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 TSSK4Q6SA08 328 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 TSG101Q99816 390 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 CILPO75339 1184 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 AP1G2O75843 785 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 TDGF1P13385 188 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 YWHAQP27348 245 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 MXI1P50539 228 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 SLC5A3P53794 718 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 SLC7A9P82251 487 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 LRRC63Q05C16 580 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 CCINQ13939 588 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 PDGFRLQ15198 375 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 KRT82Q9NSB4 513 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 FAM92AA1XBS5 289 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 KINO60870 393 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 PDE6CP51160 858 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 LRRC32Q14392 662 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 CBWD6Q4V339 395 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 Q6ZS52 159 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 RAB20Q9NX57 234 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 EML3Q32P44 896 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 FBXO32Q969P5 355 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 ECT2Q9H8V3 914 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 COMMD8Q9NX08 183 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 PATJQ8NI35 1801 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 LEFTY2O00292 366 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 STX10O60499 249 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 ABL1P00519 1130 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 CD58P19256 250 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 MAP3K7CLP57077 242 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 SATB1Q01826 763 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 TTC16Q8NEE8 873 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 TATDN2Q93075 761 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 CPQQ9Y646 472 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA3-204ENST00000521401 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 HHLA1C9JL84 531 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 PSMA7O14818 248 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 ADORA2BP29275 332 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 GJA4P35212 333 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 IFNAR2P48551 515 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 PGFP49763 221 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 CCR3P51677 355 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 MORC3Q14149 939 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 TTI2Q6NXR4 508 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 SLC35C1Q96A29 364 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA3-204ENST00000521401 GMIPQ9P107 970 aa22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms