RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520429.5

CCNC-210, Transcript of cyclin C, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNC, Length 2,473 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-210ENST00000520429 KAT6AQ92794 2004 aa14.71□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 MAGEB2O15479 319 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 HMGCRP04035 888 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 MMP3P08254 477 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ABHD2P08910 425 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 TAC1P20366 129 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 STX2P32856 288 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 TNFAIP2Q03169 654 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 POU5F1BQ06416 359 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 SLC1A5Q15758 541 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 FAXCQ5TGI0 409 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 OSMRQ99650 979 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 MIS12Q9H081 205 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 PNMA3Q9UL41 463 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 RNF8O76064 485 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 UBOX5O94941 541 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 DPYSL3Q14195 570 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 BBS9Q3SYG4 887 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 TRABDQ9H4I3 376 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 KLK14Q9P0G3 267 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 GOLGA8RI6L899 631 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 KRT15P19012 456 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 GPD1P21695 349 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ATP5DP30049 168 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ATICP31939 592 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 RBP5P82980 135 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 DNAJC3Q13217 504 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 CCL15Q16663 113 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 CENPUQ71F23 418 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 GPR142Q7Z601 462 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 DPP9Q86TI2 863 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 NETO2Q8NC67 525 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 FBF1Q8TES7 1133 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 MAML3Q96JK9 1138 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 CCDC77Q9BR77 488 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 VTA1Q9NP79 307 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 APOC2P02655 101 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 PDGFRBP09619 1106 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 LMO2P25791 158 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ITIH4Q14624 930 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 PTPN18Q99952 460 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 RNF39Q9H2S5 420 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 SPON1Q9HCB6 807 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ENDOD1O94919 500 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ASMTLO95671 621 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 PKDCCQ504Y2 493 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 FUKQ8N0W3 1084 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 C7orf31Q8N865 590 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 CNPY3Q9BT09 278 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 CD248Q9HCU0 757 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 C2CD2Q9Y426 696 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 SPTLC1O15269 473 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNC-210ENST00000520429 CCDC130P13994 396 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.6 ms