RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF91Q05481 1191 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 MYO1EQ12965 1108 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 CERCAMQ5T4B2 595 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 Q6ZTC4 211 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 ABRAQ8N0Z2 381 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRR18Q8N4B5 295 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRIM36Q9NQ86 728 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 CNNM1Q9NRU3 951 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRHDEQ9UKU6 1024 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 MED16Q9Y2X0 877 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRRC14BA6NHZ5 514 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 MYO1CO00159 1063 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADAM10O14672 748 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMPRSS11DO60235 418 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 UNC5CO95185 931 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDE8BO95263 885 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 CTSAP10619 480 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 VCAM1P19320 739 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 GKP32189 559 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 DGKEP52429 567 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 SOX8P57073 446 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 SP2Q02086 613 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 CYP1B1Q16678 543 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 ABCB5Q2M3G0 1257 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 DEPDC1Q5TB30 811 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM65Q6PI78 240 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTCHD4Q6ZW05 846 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 USP45Q70EL2 814 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP1R3BQ86XI6 285 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 GAS2L3Q86XJ1 694 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 LINC01465Q8N7H1 131 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 MEIS3Q99687 375 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM204Q9BSN7 226 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 CXorf36Q9H7Y0 433 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 TXLNGQ9NUQ3 528 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZSCAN32Q9NX65 697 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 ASIC5Q9NY37 505 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 XPR1Q9UBH6 696 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 HEY2Q9UBP5 337 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 ICKQ9UPZ9 632 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMX2Q9Y320 296 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 LACTBL1A8MY62 500 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 ALG1L2C9J202 215 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 AHSGP02765 367 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDCP20941 246 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 FPR3P25089 353 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNJ4P48050 445 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAP2K6P52564 334 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRT17Q04695 432 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMTC4Q5T4D3 741 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 COLCA1Q6ZS62 124 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 MMP21Q8N119 569 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRR25Q96S07 402 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 MESP1Q9BRJ9 268 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-397P-201ENST00000516226 ERVV-2B6SEH9 535 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 AP4M1O00189 453 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPTLC2O15270 562 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 PMPCBO75439 489 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 PGGT1BP53609 377 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCNIQ14094 377 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 PLS1Q14651 629 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF750Q32MQ0 723 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 PGS1Q32NB8 556 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC157Q569K6 752 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM240Q5SV17 173 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 GSG1LQ6UXU4 331 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 BCAS4Q8TDM0 211 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC35A4Q96G79 324 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 HIC2Q96JB3 615 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 PROCRQ9UNN8 238 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 NOTCH4Q99466 2003 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 H3BUI4 141 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 CES2O00748 559 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 AKAP10O43572 662 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 CD63P08962 238 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNA3P22001 575 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCND1P24385 295 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms