RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515585.1

ABCC3-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

TSL 3

Gene ABCC3, Length 484 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-216ENST00000515585 TADA2AO75478 443 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 ACRP10323 421 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.093e-9■□□□□ 9
ABCC3-216ENST00000515585 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 BNIPLQ7Z465 357 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CHST7Q9NS84 486 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 EHD2Q9NZN4 543 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CARNS1A5YM72 827 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 OR6C75A6NL08 312 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 F8VP50 259 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 SPOPO43791 374 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 AP1G2O75843 785 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 UQCRHP07919 91 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 FLT3P36888 993 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 EPHB4P54760 987 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 TSPY1Q01534 308 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 PTPROQ16827 1216 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 MNS1Q8NEH6 495 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 IGSF21Q96ID5 467 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 MS4A14Q96JA4 679 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 PSMB7Q99436 277 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 SYNCQ9H7C4 482 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 ST7Q9NRC1 585 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 GBF1Q92538 1859 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 TNFRSF10BO14763 440 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 LRCH4O75427 683 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 UPP2O95045 317 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 VNN2O95498 520 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 GLI1P08151 1106 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CTAGE8P0CG41 777 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 TCF4P15884 667 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 GPD1P21695 349 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 PCK1P35558 622 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 PLA2G5P39877 138 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 MAGEA11P43364 429 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 PTPN9P43378 593 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 TUBB4BP68371 445 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 TAF5Q15542 800 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 RTP2Q5QGT7 225 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 TMEM240Q5SV17 173 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 ZNF280DQ6N043 979 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 EMC1Q8N766 993 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 BADQ92934 168 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 NT5C3BQ969T7 300 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CNPY3Q9BT09 278 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 USP3Q9Y6I4 520 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 CDH23Q9H251 3354 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 TNFRSF10AO00220 468 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 FBXO21O94952 628 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 PYGMP11217 842 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 KCNA4P22459 653 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 PBX3P40426 434 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 RWDD2BP57060 319 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 MAP3K7CLP57077 242 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 SLC8A3P57103 927 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 DAOAP59103 153 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 FPGSQ05932 587 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 ADIGQ0VDE8 80 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-216ENST00000515585 GPR17Q13304 367 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms