RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 C2orf71A6NGG8 1288 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 MMP8P22894 467 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 CCND1P24385 295 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 KDELR1P24390 212 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 AKAP5P24588 427 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCG1P45844 678 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC26A7Q8TE54 656 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 EXT2Q93063 718 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 STOML1Q9UBI4 398 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF541Q9H0D2 1346 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 MYL3P08590 195 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 CTSHP09668 335 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 CYP2C8P10632 490 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SERPINB3P29508 390 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 CA8P35219 290 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 STX3Q13277 289 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 CENPTQ96BT3 561 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 VCPIP1Q96JH7 1222 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 PAK5Q9P286 719 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 MYPNQ86TC9 1320 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM191CA6NGB0 347 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 MAP3K7O43318 606 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 HMGCRP04035 888 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SKIP12755 728 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ARPP19P56211 112 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 VGLL4Q14135 290 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC1A5Q15758 541 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 C9orf131Q5VYM1 1079 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 MON1BQ7L1V2 547 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 E2F7Q96AV8 911 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 CPXM1Q96SM3 734 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 PDGFCQ9NRA1 345 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 UBP1Q9NZI7 540 aa13.32□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ZWINTO95229 277 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ASS1P00966 412 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 UNGP13051 313 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SULT1E1P49888 294 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 GAD2Q05329 585 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 POU5F1BQ06416 359 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD22Q5VYY1 191 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC25A41Q8N5S1 370 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAM32Q8TC27 787 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 HERPUD2Q9BSE4 406 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 PTPRJQ12913 1337 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 USP12O75317 370 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 VNN1O95497 513 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 STIP1P31948 543 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 RGS9BPQ6ZS82 235 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ARMCX2Q7L311 632 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP13.31□□□□□ -0.286e-6■□□□□ 8.9
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM130Q8N3G9 435 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 OSMRQ99650 979 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 TTLL13PA6NNM8 815 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 XPOTO43592 962 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC22O60826 627 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 UPP2O95045 317 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 GHRP10912 638 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 CNPY3Q9BT09 278 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SETD4Q9NVD3 440 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SNTG2Q9NY99 539 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC17A7Q9P2U7 560 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SHOC2Q9UQ13 582 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 MYH1P12882 1939 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNK1O00180 336 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ENTPD5O75356 428 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM155BO75949 473 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 RCN1Q15293 331 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 EML3Q32P44 896 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 C16orf46Q6P387 395 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ALLCQ8N6M5 410 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 B3GNT5Q9BYG0 378 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 NR2E3Q9Y5X4 410 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ACKR2O00590 384 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 WNT7BP56706 349 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 NCALDP61601 193 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 DPYSL3Q14195 570 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 MTFR1Q15390 333 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ZPBP2Q6X784 338 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms