RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503393.6

SH3BP2-207, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-207ENST00000503393 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CES2O00748 559 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CTDNEP1O95476 244 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PRKCBP05771 671 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 MAPK11Q15759 364 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CYP51A1Q16850 503 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 XKR3Q5GH77 459 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 STKLD1Q8NE28 680 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 RORBQ92753 470 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 E9PBE3 544 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PIK3CDO00329 1044 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SNPHO15079 494 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 KLHL41O60662 606 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PIK3R1P27986 724 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 KRT20P35900 424 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TAB1Q15750 504 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 FAM9CQ8IZT9 166 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 FUCA2Q9BTY2 467 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 AGAP1Q9UPQ3 857 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CYP27B1O15528 508 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 GRAP2O75791 330 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 RPA1P27694 616 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TTKP33981 857 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PPP3CCP48454 512 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 RGS7P49802 495 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 HPCAP84074 193 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ISCA1Q9BUE6 129 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CEP152O94986 1710 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PDE9AO76083 593 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PRIM2P49643 509 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TBC1D19Q8N5T2 526 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 WRNIP1Q96S55 665 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 APOL4Q9BPW4 351 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TBC1D12O60347 775 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 RRM2P31350 389 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TRAF2Q12933 501 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 XRCC4Q13426 336 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 GPAT2Q6NUI2 795 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ATG9AQ7Z3C6 839 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 LDHDQ86WU2 507 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TCF7L2Q9NQB0 619 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PCDHB8Q9UN66 801 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ACADSBP45954 432 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PCSK7Q16549 785 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 RDM1Q8NG50 284 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TMEM94Q12767 1356 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PIPSLA2A3N6 862 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 RPS6KA5O75582 802 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SUPT7LO94864 414 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 GPD1P21695 349 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 DDR2Q16832 855 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 RGS21Q2M5E4 152 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SLC26A11Q86WA9 606 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SLC10A4Q96EP9 437 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 MYO9BQ13459 2157 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 AP1G2O75843 785 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 MAP3K14Q99558 947 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TK2O00142 265 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 GRIK1P39086 918 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 STAT5BP51692 787 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 DGUOKQ16854 277 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TTC27Q6P3X3 843 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ATG4AQ8WYN0 398 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 COL15A1P39059 1388 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 RHOBTB1O94844 696 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 GZMAP12544 262 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 GTF2H3Q13889 308 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 BOLA3Q53S33 107 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 THAP1Q9NVV9 213 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SGO1Q5FBB7 561 aa16.14■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PRMT9Q6P2P2 845 aa16.14■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SVOPQ8N4V2 548 aa16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms