RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 APPL2Q8NEU8 664 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RXFP2Q8WXD0 754 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 WNT8BQ93098 351 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CYLDQ9NQC7 956 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CHST12Q9NRB3 414 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ERICH4A6NGS2 130 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ENDOD1O94919 500 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ITGAVP06756 1048 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PDGFRAP16234 1089 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GJA8P48165 433 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 BCAT1P54687 386 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 MGAT3Q09327 533 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 IFFO1Q0D2I5 559 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SLC29A2Q14542 456 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KRT71Q3SY84 523 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 BBS12Q6ZW61 710 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RNF180Q86T96 592 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 HOOK3Q86VS8 718 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TTC13Q8NBP0 860 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.033e-6■□□□□ 8.5
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 DNAI2Q9GZS0 605 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF148Q9UQR1 794 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TSC2P49815 1807 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 HCRTO43612 131 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 HUS1O60921 280 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GABBR2O75899 941 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CHRNA1P02708 482 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SHBGP04278 402 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CD48P09326 243 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 FAM163BP0C2L3 166 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 LMO2P25791 158 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SCNN1AP37088 669 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC14Q49A88 953 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CROCCP2Q86T23 111 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ZFP42Q96MM3 310 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PEBP4Q96S96 227 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SNX25Q9H3E2 840 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CENPHQ9H3R5 247 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CST8O60676 142 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GRAP2O75791 330 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ASGR1P07306 291 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PDGFRBP09619 1106 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC130P13994 396 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CHKAP35790 457 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 VPS41P49754 854 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ARSEP51690 589 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TAF5Q15542 800 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ARCQ7LC44 396 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC25Q86WR0 208 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RELL1Q8IUW5 271 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 HACE1Q8IYU2 909 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 KCTD6Q8NC69 237 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TLCD1Q96CP7 247 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TNIP3Q96KP6 325 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CFAP57Q96MR6 1250 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RSAD1Q9HA92 442 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GRIN2DO15399 1336 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.58□□□□□ -1.04
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