RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 FERP16591 822 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC9A1P19634 815 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 PON1P27169 355 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 AXLP30530 894 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 CXCR5P32302 372 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 HOXD13P35453 343 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 THPOP40225 353 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 STAT1P42224 750 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPC3P51654 580 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC7A5Q01650 507 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARID5AQ03989 594 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNA1Q09470 495 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDK5R2Q13319 367 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 DRP2Q13474 957 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPS6KA1Q15418 735 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 SURF1Q15526 300 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 KYAT1Q16773 422 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIZQ2M2Z5 673 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATF7IP2Q5U623 682 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 OGFOD3Q6PK18 319 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZPBP2Q6X784 338 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 SESTD1Q86VW0 696 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM186BQ8IYM0 893 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 HDAC7Q8WUI4 952 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.464e-7■■■□□ 18.1
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZBTB10Q96DT7 871 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASIC4Q96FT7 647 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 MS4A14Q96JA4 679 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 PBKQ96KB5 322 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 FNBP1Q96RU3 617 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 FIZ1Q96SL8 496 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPP1R16BQ96T49 567 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 CORO1BQ9BR76 489 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 MSTO1Q9BUK6 570 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIFC3Q9BVG8 833 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 FZD8Q9H461 694 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 SIX2Q9NPC8 291 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAD18Q9NS91 495 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 HSPBP1Q9NZL4 362 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 OGDHLQ9ULD0 1010 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 INTUQ9ULD6 942 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD63C9JTQ0 380 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 TULP2O00295 520 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR182O15218 404 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAPK13O15264 365 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ICMTO60725 284 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 TOM1L1O75674 476 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 AKAP3O75969 853 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 H2AFZP0C0S5 128 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 HARSP12081 509 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOP2P46087 812 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNA2P51530 1060 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 JAM2P57087 298 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADAM17P78536 824 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 BFSP2Q13515 415 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM187BQ17R55 369 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 CFAP58Q5T655 872 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOTUMQ6P988 496 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRRC31Q6UY01 552 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 RUFY4Q6ZNE9 571 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 H2AFVQ71UI9 128 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 SERINC5Q86VE9 423 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 C12orf56Q8IXR9 622 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms