RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497870.1

PLS3-208, Transcript of plastin 3, human

TSL 4

Gene PLS3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLS3-208	ENST00000497870	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	GDF15	Q99988	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	RAB27B	O00194	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	COQ9	O75208	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	KIF20A	O95235	890 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ITGA5	P08648	1049 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	HKR1	P10072	659 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	FCER1A	P12319	257 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	EGR1	P18146	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	GABRB3	P28472	473 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	SLC5A2	P31639	672 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	MPL	P40238	635 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	HSD11B2	P80365	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	NELL2	Q99435	816 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870		M0R3H8	397 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ESRRB	O95718	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	MAPK9	P45984	424 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	AVPR1B	P47901	424 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ITGA8	P53708	1063 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	KRT17	Q04695	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	TAF12	Q16514	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870		E9PLN8	166 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	NDST3	O95803	873 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	GPANK1	O95872	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ITGAM	P11215	1152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	NPPB	P16860	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ITGAL	P20701	1170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	BMP5	P22003	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	VAV2	P52735	878 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	EFR3A	Q14156	821 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	NPY5R	Q15761	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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