RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 KRT17Q04695 432 aa7.39□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 IER5Q5VY09 327 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 EFCAB12Q6NXP0 572 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 MON1BQ7L1V2 547 aa7.39□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.39□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.39□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 SKOR1P84550 965 aa7.39□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 MAMLD1Q13495 774 aa7.39□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.39□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CISHQ9NSE2 258 aa7.39□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 POLIQ9UNA4 740 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 E7EVH7 732 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 PODXLO00592 558 aa7.38□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 ACSL3O95573 720 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 ASS1P00966 412 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 SETSIPP0DME0 302 aa7.38□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 MDH1P40925 334 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 RAB27AP51159 221 aa7.38□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.38□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF699Q32M78 642 aa7.38□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 TFAP2BQ92481 460 aa7.38□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 FAM81BQ96LP2 452 aa7.38□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 C17orf102A2RUQ5 167 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 LINC01553A4QN01 128 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 F8VP50 259 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 FAM189A1O60320 539 aa7.37□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 ADCY8P40145 1251 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 FOXK2Q01167 660 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CCDC38Q502W7 563 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 WDR49Q8IV35 697 aa7.37□□□□□ -1.23
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