RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 SNX16P57768 344 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 LILRA4P59901 499 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 KYNUQ16719 465 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 C6orf118Q5T5N4 469 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 RSPH3Q86UC2 560 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 CRYBG2Q8N1P7 616 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 TTC13Q8NBP0 860 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 PGM2Q96G03 612 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 ADAM7Q9H2U9 754 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 C10orf88Q9H8K7 445 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 PTGESO14684 152 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 RARBP10826 455 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 LSP1P33241 339 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 CDH6P55285 790 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 TRIM32Q13049 653 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 SCYL2Q6P3W7 929 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 ADGRF2Q8IZF7 708 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD52Q8NB46 1076 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 BCAS4Q8TDM0 211 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 WNT8BQ93098 351 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 TMEM109Q9BVC6 243 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 MEIS3P2A8K0S8 358 aa17.52■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 RASGRF2O14827 1237 aa17.52■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 TTC4O95801 387 aa17.52■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 SDC4P31431 198 aa17.52■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 BCAT1P54687 386 aa17.52■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 BST2Q10589 180 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 CROCCP2Q86T23 111 aa17.52■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 SLC2A14Q8TDB8 520 aa17.52■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 STK32AQ8WU08 396 aa17.52■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 MMRN1Q13201 1228 aa17.52■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 FAM172AQ8WUF8 416 aa17.52■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP17.52■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 DNAI2Q9GZS0 605 aa17.52■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 RSAD1Q9HA92 442 aa17.52■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa17.52■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 LCP1P13796 627 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 PRKCZQ05513 592 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 CLEC4CQ8WTT0 213 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 PCDH9Q9HC56 1237 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 NINJ2Q9NZG7 142 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 DPYSL4O14531 572 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 SEPT4O43236 478 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 CHRNA1P02708 482 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 KRT81Q14533 505 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 LONRF1Q17RB8 773 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 FAM105AQ9NUU6 356 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 CACNG4Q9UBN1 327 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa17.51■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 APOC2P02655 101 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 DESP17661 470 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 LRPAP1P30533 357 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 MLH1P40692 756 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 GDF10P55107 478 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 LIMS2Q7Z4I7 341 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 OSTM1Q86WC4 334 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 RSAD2Q8WXG1 361 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 TNIP3Q96KP6 325 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 C9orf72Q96LT7 481 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 CYB561D2O14569 222 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 DPYSL3Q14195 570 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 SERINC5Q86VE9 423 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 TOP6BLQ8N6T0 577 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 LPPQ93052 612 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 RSPH14Q9UHP6 348 aa17.5■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 ATP2C2O75185 946 aa17.49■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 ENDOD1O94919 500 aa17.49■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 AGTP01019 485 aa17.49■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 WARSP23381 471 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 CDR1P51861 262 aa17.49■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 AUHQ13825 339 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
TOM1-216ENST00000492723 PTGISQ16647 500 aa17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms