RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 NCAPGQ9BPX3 1015 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 NACA2Q9H009 215 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 CLDND1Q9NY35 253 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 ADAM22Q9P0K1 906 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 MTCH2Q9Y6C9 303 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 TSC2P49815 1807 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 SLC38A8A6NNN8 435 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 SOBPA7XYQ1 873 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 ZSCAN12O43309 604 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 ZBED1O96006 694 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 GLI1P08151 1106 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 H2AFZP0C0S5 128 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 SPATA31D3P0C874 917 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 PFKLP17858 780 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 SCNN1AP37088 669 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 MTHFRP42898 656 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 GPD2P43304 727 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 TKTL1P51854 596 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 SLC5A3P53794 718 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 FMO1Q01740 532 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 CENPCQ03188 943 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 MTA1Q13330 715 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 PDCLQ13371 301 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 DDR2Q16832 855 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 AAK1Q2M2I8 961 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 H2AFVQ71UI9 128 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 PIGZQ86VD9 579 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 MON1AQ86VX9 555 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 SCML4Q8N228 414 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 RNF139Q8WU17 664 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 SLC35F5Q8WV83 523 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 FBXO32Q969P5 355 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 SELENOOQ9BVL4 669 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 TSGA10Q9BZW7 698 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 PARVAQ9NVD7 372 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 TMLHEQ9NVH6 421 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 RRN3Q9NYV6 651 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 INTUQ9ULD6 942 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 COG5Q9UP83 839 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 VWA8A3KMH1 1905 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 EPOPA6NHQ4 379 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 ADAM12O43184 909 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 HCRTO43612 131 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFA10O95299 355 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 ABL1P00519 1130 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 FTLP02792 175 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC175P0C221 793 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 LCP1P13796 627 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 EPCAMP16422 314 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 MSNP26038 577 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 GBP1P32455 592 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 NOMO3P69849 1222 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 GPC5P78333 572 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 HYAL1Q12794 435 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 KIF5AQ12840 1032 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 ADAM15Q13444 863 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 BTBD8Q5XKL5 378 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 OR6B2Q6IFH4 312 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 ANKRD54Q6NXT1 300 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 DENND1BQ6P3S1 775 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 DCUN1D2Q6PH85 259 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 SPRED2Q7Z698 418 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM110Q86TL2 294 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 TTC30AQ86WT1 665 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 RHOT2Q8IXI1 618 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 VN1R2Q8NFZ6 395 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 GIPC2Q8TF65 315 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 SLC20A1Q8WUM9 679 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 CPA5Q8WXQ8 436 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-210ENST00000486889 FAM149B1Q96BN6 582 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms