RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 PARD6AQ9NPB6 346 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 NME7Q9Y5B8 376 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 MYH10P35580 1976 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 CLDN5O00501 218 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 PDXKO00764 312 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 NR3C1P04150 777 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 SYKP43405 635 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 CDH8P55286 799 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 SLC7A9P82251 487 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 CSRP2Q16527 193 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 FBXO32Q969P5 355 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 LINC00597Q9H2U6 94 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 CPQQ9Y646 472 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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ACTB-212ENST00000484841 RAP1GAPP47736 663 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 SYT13Q7L8C5 426 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.41■■□□□ 1.02
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ACTB-212ENST00000484841 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 HHIPQ96QV1 700 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 DMAC2Q9NW81 257 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 AXIN1O15169 862 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 AKAP3O75969 853 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 CLDN10P78369 228 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 TMC2Q8TDI7 906 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 OVCA2Q8WZ82 227 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 TAF4BQ92750 862 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 LOXL4Q96JB6 756 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 NACA2Q9H009 215 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 RNF38Q9H0F5 515 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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ACTB-212ENST00000484841 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 ZNF292O60281 2723 aa21.39■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 APBB3O95704 486 aa21.39■■□□□ 1.01
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ACTB-212ENST00000484841 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 KCNK16Q96T55 309 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 COMMD8Q9NX08 183 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 CFAP97Q9P2B7 532 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.39■■□□□ 1.01
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ACTB-212ENST00000484841 OLFM2O95897 454 aa21.38■■□□□ 1.01
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ACTB-212ENST00000484841 DLG4P78352 724 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ZACNQ401N2 412 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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ACTB-212ENST00000484841 ACOT1Q86TX2 421 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 KRT82Q9NSB4 513 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 AP1G2O75843 785 aa21.37■■□□□ 1.01
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ACTB-212ENST00000484841 RPL13P26373 211 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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ACTB-212ENST00000484841 VAMP7P51809 220 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 SEC13P55735 322 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 ELF2Q15723 593 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 C2orf27AQ580R0 203 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 UNC93AQ86WB7 457 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 TSTD1Q8NFU3 115 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 HPSEQ9Y251 543 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 DCDC2BA2VCK2 349 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 RHOBTB1O94844 696 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 VNN1O95497 513 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-212ENST00000484841 CYP17A1P05093 508 aa21.36■■□□□ 1.01
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