RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484481.1

MCTS1-204, Transcript of MCTS1, re-initiation and release factor, human

TSL 2

Gene MCTS1, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MCTS1-204	ENST00000484481	VPS16	Q9H269	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	MYO1C	O00159	1063 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	FGA	P02671	866 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	MYB	P10242	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	GK	P32189	559 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481		Q4G0T1	1027 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MCTS1-204	ENST00000484481	USP19	O94966	1318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481		A0A1W2PPL8	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	PMPCB	O75439	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	USP1	O94782	785 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	NTN1	O95631	604 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	BCAT1	P54687	386 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	SATB1	Q01826	763 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	SPRY2	O43597	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	BMP15	O95972	392 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	PRKAG1	P54619	331 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	CCNI	Q14094	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481		A6NNZ2	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481		M0R3H8	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	THBS4	P35443	961 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	DIO1	P49895	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	EPHB1	P54762	984 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	LMAN2	Q12907	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	RAB32	Q13637	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	RABEP1	Q15276	862 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	SEC23B	Q15437	767 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	NPY5R	Q15761	445 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MCTS1-204	ENST00000484481	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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