RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484281.1

RAB18-205, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB18, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-205	ENST00000484281	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	TDO2	P48775	406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	SEPHS1	P49903	392 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	SEMG2	Q02383	582 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	KLF10	Q13118	480 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	LPIN1	Q14693	890 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	G2E3	Q7L622	706 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	STK32C	Q86UX6	486 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	F5	P12259	2224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PLK4	O00444	970 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	AURKA	O14965	403 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	EXTL3	O43909	919 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	SH3BP5	O60239	455 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ATP9A	O75110	1047 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	RFPL2	O75678	378 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	CHRNA1	P02708	482 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PRF1	P14222	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ENG	P17813	658 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	CA8	P35219	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PPP2CB	P62714	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PPP2CA	P67775	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	MYH1	P12882	1939 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	MUSK	O15146	869 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	GPR42	O15529	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	NPHS1	O60500	1241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	CXCL14	O95715	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	F2	P00734	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	FUCA1	P04066	466 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	IMPDH2	P12268	514 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PAM	P19021	973 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ADORA1	P30542	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	TRDN	Q13061	729 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	MTA1	Q13330	715 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	GLG1	Q92896	1179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	MKL1	Q969V6	931 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB18-205	ENST00000484281	STARD5	Q9NSY2	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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