RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483676.1

PLXNB1-215, Transcript of plexin B1, humanhuman

TSL 2

Gene PLXNB1, Length 367 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1-215ENST00000483676 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 MTF1Q14872 753 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 INF2Q27J81 1249 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 EML3Q32P44 896 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 USP37Q86T82 979 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 FSIP1Q8NA03 581 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 LRRC15Q8TF66 581 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 BSNDQ8WZ55 320 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 FAM20AQ96MK3 541 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 ACAP3Q96P50 834 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 USP28Q96RU2 1077 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 TRIM4Q9C037 500 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 GAREM1Q9H706 876 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 IL17BQ9UHF5 180 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 LRRK2Q5S007 2527 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 SYCE3A1L190 88 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 OR6C75A6NL08 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 LAD1O00515 517 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 KCNK3O14649 394 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 ADAM23O75077 832 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 C6P13671 934 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 GNSP15586 552 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 ATF6P18850 670 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 SLC19A1P41440 591 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 WASP42768 502 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 RARRES1P49788 294 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 CSRP3P50461 194 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 NLRP12P59046 1061 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 TPM4P67936 248 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 SPAG1Q07617 926 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 VEPH1Q14D04 833 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 SLC39A14Q15043 492 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 SEZ6Q53EL9 994 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 XKR4Q5GH76 650 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 EOGTQ5NDL2 527 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 MON1AQ86VX9 555 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 BLIDQ8IZY5 108 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 STKLD1Q8NE28 680 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 DEPTORQ8TB45 409 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 SPATA18Q8TC71 538 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 ATP2A3Q93084 1043 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 THAP11Q96EK4 314 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 NACC1Q96RE7 527 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 SLC22A12Q96S37 553 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 CDC6Q99741 560 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 TCHPQ9BT92 498 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.49□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa6.49□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 MYMKA6NI61 221 aa6.49□□□□□ -1.37
PLXNB1-215ENST00000483676 BTBD18B2RXH4 712 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms