RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 YWHAQP27348 245 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ATICP31939 592 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 GJA4P35212 333 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 GCLMP48507 274 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 PDE6CP51160 858 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 VAMP7P51809 220 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 AP3M2P53677 418 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CACNA2D1P54289 1103 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 EHHADHQ08426 723 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 BECN1Q14457 450 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC6Q16204 474 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 C2orf27AQ580R0 203 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 WDR44Q5JSH3 913 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 FAM186BQ8IYM0 893 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 NUP93Q8N1F7 819 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 RIN3Q8TB24 985 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CD101Q93033 1021 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TNIP3Q96KP6 325 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SPATA17Q96L03 361 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 MYRFLQ96LU7 910 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 IER2Q9BTL4 223 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ECT2Q9H8V3 914 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 INVSQ9Y283 1065 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 NME7Q9Y5B8 376 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CPQQ9Y646 472 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF840PA6NDX5 716 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 PDXKO00764 312 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 AXIN1O15169 862 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 HRO43593 1189 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF202O95125 648 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 VNN1O95497 513 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 NFATC1O95644 943 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 HLA-DRAP01903 254 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 RPL13P26373 211 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 NDST1P52848 882 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 MAP3K7CLP57077 242 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 KDSRQ06136 332 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ADAM9Q13443 819 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CCINQ13939 588 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF77Q15935 545 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF394Q53GI3 561 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ISM2Q6H9L7 571 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SV2AQ7L0J3 742 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 FAM35AQ86V20 835 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 LONP2Q86WA8 852 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 C12orf29Q8N999 325 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 C8orf48Q96LL4 319 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 RNF38Q9H0F5 515 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SDCBP2Q9H190 292 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 EPC1Q9H2F5 836 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 KCTD10Q9H3F6 313 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 GCNT4Q9P109 453 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 EML5Q05BV3 1969 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 K7ESF4 209 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 LILRB5O75023 590 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 DRD1P21728 446 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 GBP1P32455 592 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 DGKEP52429 567 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 USP4Q13107 963 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 PNOCQ13519 176 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ANO4Q32M45 955 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 EML3Q32P44 896 aa8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms