RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		11.34	□□□□□ -0.59
APTX-222	ENST00000478279	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.34	□□□□□ -0.59
APTX-222	ENST00000478279	C12orf40	Q86WS4	652 aa		11.34	□□□□□ -0.59
APTX-222	ENST00000478279	MDM1	Q8TC05	714 aa		11.34	□□□□□ -0.59
APTX-222	ENST00000478279	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		11.34	□□□□□ -0.59
APTX-222	ENST00000478279	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		11.34	□□□□□ -0.59
APTX-222	ENST00000478279	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		11.34	□□□□□ -0.59
APTX-222	ENST00000478279	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
APTX-222	ENST00000478279	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
APTX-222	ENST00000478279	RAX	Q9Y2V3	346 aa		11.34	□□□□□ -0.59
APTX-222	ENST00000478279	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		11.34	□□□□□ -0.59
APTX-222	ENST00000478279	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	TISP43	B9A030	160 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	IL18RAP	O95256	599 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	ADH1C	P00326	375 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	GABRG2	P18507	467 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	PCSK1	P29120	753 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	LHX1	P48742	406 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	CCDC142	Q17RM4	750 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	FAM171B	Q6P995	826 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	VSTM1	Q6UX27	236 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	OSTM1	Q86WC4	334 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	GPBP1	Q86WP2	473 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	NAXD	Q8IW45	347 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	SPATA17	Q96L03	361 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	FIZ1	Q96SL8	496 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	RNF38	Q9H0F5	515 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	CPQ	Q9Y646	472 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	PTPRB	P23467	1997 aa		11.33	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	KNTC1	P50748	2209 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	GABRD	O14764	452 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	ZNF217	O75362	1048 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	OLFM2	O95897	454 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	ITGB3	P05106	788 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	ADH5	P11766	374 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	PPP3CC	P48454	512 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	USP46	P62068	366 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	KDSR	Q06136	332 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	GLRX5	Q86SX6	157 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	EHD2	Q9NZN4	543 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	DKK4	Q9UBT3	224 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		11.32	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	SLC26A4	O43511	780 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	HCRT	O43612	131 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	ATP2C2	O75185	946 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	HOXB2	P14652	356 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	PLCG1	P19174	1290 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	ADSS	P30520	456 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	NTSR1	P30989	418 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	GRIK1	P39086	918 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	GAD2	Q05329	585 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	POSTN	Q15063	836 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	ADAM32	Q8TC27	787 aa		11.31	□□□□□ -0.6
APTX-222	ENST00000478279	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6

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