RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477087.1

CDKN1B-204, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

TSL 3

Gene CDKN1B, Length 453 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1B-204ENST00000477087 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.51□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.51□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.51□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.51□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 ZMAT4Q9H898 229 aa6.51□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.51□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 IL23AQ9NPF7 189 aa6.51□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 NCDNQ9UBB6 729 aa6.51□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 PLAAQ9Y263 795 aa6.51□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.51□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 TMEM232C9JQI7 657 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 TBX3O15119 743 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 OPHN1O60890 802 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 FSBPO95073 299 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 SLPIP03973 132 aa6.5□□□□□ -1.37
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CDKN1B-204ENST00000477087 C1SP09871 688 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 EPHX2P34913 555 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 DGCR2P98153 550 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 PPATQ06203 517 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 LRRC32Q14392 662 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 GPR162Q16538 588 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 SHC4Q6S5L8 630 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 NEK8Q86SG6 692 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 MIEF2Q96C03 454 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 MTMR9Q96QG7 549 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 DACT1Q9NYF0 836 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 ABCB11O95342 1321 aa6.5□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 LAMB1P07942 1786 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 MYH1P12882 1939 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 MEIS2O14770 477 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 EDIL3O43854 480 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 KINO60870 393 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 DTNBO60941 627 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 PCDH8O95206 1070 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 ICAM1P05362 532 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 MCM7P33993 719 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 ADAM8P78325 824 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 COG2Q14746 738 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 CCDC96Q2M329 555 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 SPATA20Q8TB22 786 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 MFSD3Q96ES6 412 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 CUEDC2Q9H467 287 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 GGA3Q9NZ52 723 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 MSRAQ9UJ68 235 aa6.49□□□□□ -1.37
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CDKN1B-204ENST00000477087 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.49□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 CCDC192P0DO97 292 aa6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 NF2P35240 595 aa6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 SLC16A2P36021 539 aa6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 SREBF1P36956 1147 aa6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 SYKP43405 635 aa6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 KIR2DL3P43628 341 aa6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 NDUFA8P51970 172 aa6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 IL2P60568 153 aa6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 SPP2Q13103 211 aa6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 KLF10Q13118 480 aa6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 TUBA3CQ13748 450 aa6.48□□□□□ -1.37
CDKN1B-204ENST00000477087 Q4G0T1 1027 aa6.48□□□□□ -1.37
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