RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 SPAG1Q07617 926 aa8.48□□□□□ -1.05
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SZRD1-208ENST00000476423 TAF12Q16514 161 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 SGO2Q562F6 1265 aa8.48□□□□□ -1.05
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SZRD1-208ENST00000476423 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.48□□□□□ -1.05
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SZRD1-208ENST00000476423 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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SZRD1-208ENST00000476423 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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SZRD1-208ENST00000476423 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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SZRD1-208ENST00000476423 HIP1RO75146 1068 aa8.47□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 RFPL3O75679 317 aa8.47□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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SZRD1-208ENST00000476423 SLC16A4O15374 487 aa8.46□□□□□ -1.06
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SZRD1-208ENST00000476423 HIC2Q96JB3 615 aa8.46□□□□□ -1.06
SZRD1-208ENST00000476423 SUSD3Q96L08 255 aa8.46□□□□□ -1.06
SZRD1-208ENST00000476423 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SZRD1-208ENST00000476423 GMIPQ9P107 970 aa8.46□□□□□ -1.06
SZRD1-208ENST00000476423 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.46□□□□□ -1.06
SZRD1-208ENST00000476423 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
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