RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471572.6

NF1-208, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

TSL 2

Gene NF1, Length 2,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-208ENST00000471572 CYP27A1Q02318 531 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 MIB1Q86YT6 1006 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 CNTROBQ8N137 903 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 LINS1Q8NG48 757 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 NCSTNQ92542 709 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ABCG4Q9H172 646 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ZNF785A8K8V0 405 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 KIF28PB7ZC32 967 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 MYO1CO00159 1063 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 TBX10O75333 385 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 GNAI2P04899 355 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 SCG2P13521 617 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 PNLIPP16233 465 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 SLC5A2P31639 672 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ICAM3P32942 547 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 PTPN7P35236 360 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ADCY8P40145 1251 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 CYP4F8P98187 520 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 PTP4A2Q12974 167 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ADGRE1Q14246 886 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 KYNUQ16719 465 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 MANEALQ5VSG8 457 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 AFMIDQ63HM1 303 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 TAGAPQ8N103 731 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 CPT1BQ92523 772 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 PEX11GQ96HA9 241 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 MECRQ9BV79 373 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 NUP160Q12769 1436 aa6.68□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 M0QYG6 137 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 VIPP01282 170 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 MT-ND3P03897 115 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ZNF131P52739 623 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 NFIXQ14938 502 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 NFIL3Q16649 462 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 PLA1AQ53H76 456 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 VASNQ6EMK4 673 aa6.67□□□□□ -1.34
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NF1-208ENST00000471572 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 GPR150Q8NGU9 434 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ING3Q9NXR8 418 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 HPSEQ9Y251 543 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 SRGAP3O43295 1099 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 TNFSF14O43557 240 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 SLC43A1O75387 559 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 PTTG1IPP53801 180 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 UBXN2AP68543 259 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 AP1B1Q10567 949 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ADAM15Q13444 863 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ATP1A4Q13733 1029 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 LRRC24Q50LG9 513 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 GPR149Q86SP6 731 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.67□□□□□ -1.34
NF1-208ENST00000471572 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.67□□□□□ -1.34
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