RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	HCRT	O43612	131 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	BEST1	O76090	585 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ZBED1	O96006	694 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SERPING1	P05155	500 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SPATA31D3	P0C874	917 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	BMP1	P13497	986 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CD19	P15391	556 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	KCNA5	P22460	613 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MMP8	P22894	467 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	YWHAQ	P27348	245 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MRE11	P49959	708 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SLC5A3	P53794	718 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CACNA2D1	P54289	1103 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CENPC	Q03188	943 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PDE4C	Q08493	712 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MTA1	Q13330	715 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	DDR2	Q16832	855 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF394	Q53GI3	561 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PMF1	Q6P1K2	205 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	GAREM2	Q75VX8	874 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PIGZ	Q86VD9	579 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ASB2	Q96Q27	587 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PANX2	Q96RD6	677 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	KRT82	Q9NSB4	513 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	THEG	Q9P2T0	379 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CDH7	Q9ULB5	785 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	NR2E1	Q9Y466	385 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CEP83	Q9Y592	693 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SCN1A	P35498	2009 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MUC3A	Q02505	3323 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	NCOR1	O75376	2440 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	LRRC53	A6NM62	1247 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ANHX	E9PGG2	379 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CLDN5	O00501	218 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	THAP12	O43422	761 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MFAP3L	O75121	409 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MOSPD3	O75425	235 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	GABBR2	O75899	941 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	LAMP2	P13473	410 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CCDC130	P13994	396 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CHRNB2	P17787	502 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	FSHR	P23945	695 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CASP14	P31944	242 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CA8	P35219	290 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	USP8	P40818	1118 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	MAP3K7CL	P57077	242 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SLC7A9	P82251	487 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	FMO1	Q01740	532 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PDCL	Q13371	301 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	NNT	Q13423	1086 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TCEAL1	Q15170	157 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TAF12	Q16514	161 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	WDR59	Q6PJI9	974 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	VPS36	Q86VN1	386 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NFX1-205	ENST00000466359	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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