RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 HHATQ5VTY9 493 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 FYB2Q5VWT5 728 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 KAZNQ674X7 775 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CYS1Q717R9 158 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZNF410Q86VK4 478 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PALM2Q8IXS6 379 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TMEM237Q96Q45 408 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 WBP1LQ9NX94 342 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PAK5Q9P286 719 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 IKBKGQ9Y6K9 419 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CLUHO75153 1309 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GPR25O00155 361 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 DPYSL4O14531 572 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CST8O60676 142 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 FKTNO75072 461 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 LRCH4O75427 683 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 WFS1O76024 890 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TGDSO95455 350 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GNRH1P01148 92 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GH1P01241 217 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CFHP08603 1231 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 STAG3L1P0CL83 205 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 KRT10P13645 584 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TAC1P20366 129 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GPD1P21695 349 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CCND1P24385 295 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TNFSF9P41273 254 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 MSH2P43246 934 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 IFNAR2P48551 515 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 NR2C2P49116 596 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 DBN1Q16643 649 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 LY6KQ17RY6 165 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 PARP6Q2NL67 630 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 WLSQ5T9L3 541 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 UNC93AQ86WB7 457 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 XYLT1Q86Y38 959 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 NAT8LQ8N9F0 302 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ACTL9Q8TC94 416 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 TFAP2BQ92481 460 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 INPP5DQ92835 1189 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 RTP4Q96DX8 246 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 C9orf72Q96LT7 481 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 ACAP3Q96P50 834 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 CDT1Q9H211 546 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 SAR1AQ9NR31 198 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 USP18Q9UMW8 372 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-208ENST00000464611 LCTP09848 1927 aa8.9□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 LACTBL1A8MY62 500 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 E7ENQ6 273 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PRPSAP2O60256 369 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 C22orf31O95567 290 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 KRT19P08727 400 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ALADP13716 330 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CCNB1P14635 433 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CA4P22748 312 aa8.89□□□□□ -0.99
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