RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462993.1

SNX10-208, Transcript of sorting nexin 10, human

TSL 1 (best)

Gene SNX10, Length 806 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX10-208	ENST00000462993	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	NTSR2	O95665	410 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	KIT	P10721	976 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	NPR1	P16066	1061 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	PRELP	P51888	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	ARFIP2	P53365	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	C1QTNF8	P60827	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	RAP2B	P61225	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	FMO1	Q01740	532 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	TBCB	Q99426	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	ADCY9	O60503	1353 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	GJB1	P08034	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	GNAI3	P08754	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	MGAT1	P26572	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	SLC7A1	P30825	629 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	PHKA1	P46020	1223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	HTR3A	P46098	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	TM4SF4	P48230	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	SOX8	P57073	446 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	NOMO3	P69849	1222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	DGCR2	P98153	550 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	MORC3	Q14149	939 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	BRD3	Q15059	726 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	CNGA2	Q16280	664 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993		Q6ZSN1	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	G2E3	Q7L622	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	ABCC4	O15439	1325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	COL4A1	P02462	1669 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SNX10-208	ENST00000462993	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	TBX3	O15119	743 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	HAUS5	O94927	633 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	TH	P07101	528 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	MYL3	P08590	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	RARB	P10826	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	RABGGTB	P53611	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	HHEX	Q03014	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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