RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454278.5

ZNF638-208, Transcript of zinc finger protein 638, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF638, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF638-208ENST00000454278 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 KDSRQ06136 332 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 OSTM1Q86WC4 334 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 SCN4BQ8IWT1 228 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 MYCT1Q8N699 235 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 TTLL2Q9BWV7 592 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 OAS1P00973 400 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 ITGB3P05106 788 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 PCSK1P29120 753 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 EMC10Q5UCC4 262 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 FAM171BQ6P995 826 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 RHBDF2Q6PJF5 856 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 VSTM1Q6UX27 236 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 GPBP1Q86WP2 473 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 CCDC83Q8IWF9 413 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 ADGRF2Q8IZF7 708 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 TOP6BLQ8N6T0 577 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 PNPLA1Q8N8W4 532 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 CXorf38Q8TB03 319 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 ADAM32Q8TC27 787 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 PLIN2Q99541 437 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 GDAP2Q9NXN4 497 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 EHD2Q9NZN4 543 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 SUSD2Q9UGT4 822 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 RAXQ9Y2V3 346 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 CPQQ9Y646 472 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 ZNF840PA6NDX5 716 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 SLC26A4O43511 780 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 HCRTO43612 131 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 CBFA2T3O75081 653 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 ZNF217O75362 1048 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 HOXB2P14652 356 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 PPP3CCP48454 512 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 LHX1P48742 406 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 NEK4P51957 841 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 WNT7BP56706 349 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 USP46P62068 366 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 PLEKHG6Q3KR16 790 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 BRSK2Q8IWQ3 736 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 TERB1Q8NA31 727 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 MYLPFQ96A32 169 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 LRIG1Q96JA1 1093 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 HSPA12BQ96MM6 686 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 CD248Q9HCU0 757 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF638-208ENST00000454278 A0A1W2PQF6 199 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 VWA3AA6NCI4 1184 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 GAD2Q05329 585 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 GRIK2Q13002 908 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 DPH6Q7L8W6 267 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 DEFB119Q8N690 84 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 TRIML1Q8N9V2 468 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 FAM184AQ8NB25 1140 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 POMGNT1Q8WZA1 660 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 HVCN1Q96D96 273 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 OTUB2Q96DC9 234 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 RNF38Q9H0F5 515 aa11.83□□□□□ -0.52
ZNF638-208ENST00000454278 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97 ms