RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 MCF2LO15068 1137 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 PFKMP08237 780 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 GPD1P21695 349 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 OSBPP22059 807 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC15Q0P6D6 951 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 LAMC2Q13753 1193 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 NOMO1Q15155 1222 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 NPNTQ6UXI9 565 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 FBF1Q8TES7 1133 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.74■□□□□ 0.27
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SHQ1-202ENST00000444040 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 AKT3Q9Y243 479 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 E5RJQ4 531 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 PIAS1O75925 651 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 KRT4P19013 534 aa16.74■□□□□ 0.27
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SHQ1-202ENST00000444040 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa16.74■□□□□ 0.27
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SHQ1-202ENST00000444040 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 TSPAN16Q9UKR8 245 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 C2CD2Q9Y426 696 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa16.74■□□□□ 0.27
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SHQ1-202ENST00000444040 STIP1P31948 543 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 RDXP35241 583 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 CDH6P55285 790 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 MTM1Q13496 603 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 KYAT1Q16773 422 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 DPH6Q7L8W6 267 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 PDIK1LQ8N165 341 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 OPTNQ96CV9 577 aa16.74■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 PIK3R2O00459 728 aa16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 EDF1O60869 148 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 PDGFRAP16234 1089 aa16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 BASP1P80723 227 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 KLHL38Q2WGJ6 581 aa16.73■□□□□ 0.27
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SHQ1-202ENST00000444040 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 DCAKDQ8WVC6 231 aa16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 NOD2Q9HC29 1040 aa16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 DPP3Q9NY33 737 aa16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 TSPAN1O60635 241 aa16.73■□□□□ 0.27
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SHQ1-202ENST00000444040 RBP5P82980 135 aa16.73■□□□□ 0.27
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SHQ1-202ENST00000444040 C12orf29Q8N999 325 aa16.73■□□□□ 0.27
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SHQ1-202ENST00000444040 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.73■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 CCNB1P14635 433 aa16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 IL4RP24394 825 aa16.72■□□□□ 0.27
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SHQ1-202ENST00000444040 ROR1Q01973 937 aa16.72■□□□□ 0.27
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SHQ1-202ENST00000444040 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 PALM2Q8IXS6 379 aa16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 KLHL29Q96CT2 875 aa16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 ACAP3Q96P50 834 aa16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 NT5C1AQ9BXI3 368 aa16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1B0GUA9 196 aa16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 ZWINTO95229 277 aa16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
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SHQ1-202ENST00000444040 MTHFD1LQ6UB35 978 aa16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF276Q8N554 614 aa16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 PPTC7Q8NI37 304 aa16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 RNF157Q96PX1 679 aa16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 USP29Q9HBJ7 922 aa16.72■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 GRAP2O75791 330 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF286BP0CG31 522 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 KCNJ11Q14654 390 aa16.71■□□□□ 0.27
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SHQ1-202ENST00000444040 PKDCCQ504Y2 493 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 FAM47CQ5HY64 1035 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 NT5DC4Q86YG4 428 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 TTC39CQ8N584 583 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 LRRC8CQ8TDW0 803 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 AFG1LQ8WV93 481 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 COL1A2P08123 1366 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 ELK3P41970 407 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 MSH2P43246 934 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 CBLBQ13191 982 aa16.71■□□□□ 0.27
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