RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436724.5

PTPRF-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 2,168 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-207ENST00000436724 DUSP16Q9BY84 665 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 LRRC19Q9H756 370 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.146e-6■■□□□ 12.8
PTPRF-207ENST00000436724 RNF8O76064 485 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 TCTN1Q2MV58 587 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 PEBP4Q96S96 227 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 CNPY3Q9BT09 278 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 USP18Q9UMW8 372 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 INPPL1O15357 1258 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 ODC1P11926 461 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 NPR3P17342 541 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 ODF2Q5BJF6 829 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 SCLYQ96I15 445 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 ERP44Q9BS26 406 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 KRT82Q9NSB4 513 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-207ENST00000436724 AGPSO00116 658 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 CD48P09326 243 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 CACNA2D1P54289 1103 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 MAP3K7CLP57077 242 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 EMBQ6PCB8 327 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 SEC14L1Q92503 715 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 TSC2P49815 1807 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 CDKN2BP42772 138 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 ADIGQ0VDE8 80 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 HSPH1Q92598 858 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 HSFY1Q96LI6 401 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 KCNK16Q96T55 309 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 DCLK3Q9C098 648 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 WBP1LQ9NX94 342 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 SCN5AQ14524 2016 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 ENPP3O14638 875 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 RNF40O75150 1001 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 KRT7P08729 469 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 FNTAP49354 379 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 NDUFV1P49821 464 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 CUL1Q13616 776 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 DUPD1Q68J44 220 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 RAB17Q9H0T7 212 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 FAM187AA6NFU0 413 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 M0QZQ0 153 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 PITPNM1O00562 1244 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 GGCXP38435 758 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 CCL23P55773 120 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 SNX16P57768 344 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 PLCB3Q01970 1234 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 DSC1Q08554 894 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 ACAP1Q15027 740 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 ZSCAN26Q16670 478 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 FAM35AQ86V20 835 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 UROC1Q96N76 676 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 TMEM209Q96SK2 561 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 CDH9Q9ULB4 789 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 SNX24Q9Y343 169 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 FAM200BP0CF97 657 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 SDC4P31431 198 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 CETN2P41208 172 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 GATMP50440 423 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 SLC8A3P57103 927 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 CAVIN3Q969G5 261 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 HAUS1Q96CS2 278 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-207ENST00000436724 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.12■■□□□ 1.13
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